Арт-Центр располагает следующими творческими подразделениями:

Флигель А:

1. Музыкальный клуб-кафе «FishFabrique» – 1 этаж
2. Центр танцевальной, альтернативной и экспериментальной музыки «База» – 1 этаж

Двор:

3. Мобильный Арт-Проект «Парник»

Флигель В:

4. Зал FABRIQUE NOUVELLE
5. «Арт-Бюро», информационное бюро, книжный клуб – 1 этаж
6. Музей Новой Академии Изящных Искусств / Музей современного искусства – 4 этаж
7. Галерея «Navicula Artis» – 4 этаж
8. Русский инженерный театр группы «АХЕ» (студия №508) – 5 этаж
9. Галерея «Арт-Лига» – 7 этаж

Флигель C:

10. Офис Храма Любви, Мира и Музыки им. Джона Леннона – 1 этаж
11. Художественное издательство «Петрополь» – 2 этаж
12. Петербургский архив и библиотека независимого искусства (ПАИБНИ) – 2 этаж
13. Галерея-коридор «Самиздат А4» – 2 этаж
14. Студия «Дебошир Фильм» – 2 этаж
15. Организация владельцев интеллектуальной собственности (АНОВИС) – 2 этаж
16. Галерея «ФотоImage» – 2 этаж
17. Администрация Арт-Центра (офис №1) – 3 этаж
18. Комитет «Граждане Санкт-Петербурга»
19. «Мост через Стикс», авторская галерея Вадима Воинова – 4 этаж
20 Музей Нонконформистского Искусства (МНИ), Большой зал – 4 этаж
21. Галерея «Дверь» – площадка между 4 и 5 этажами
22. Студия изобразительных искусств – 5 этаж
23. Продюсерский центр «Стоп Тайм» – 7 этаж

Флигель D:

24. Техно-Арт-Центр – 1 этаж
25. Музей Нонконформистского Искусства (МНИ), Малый зал – 2 этаж
26. Галерея Экспериментального Звука – 21 (ГЭЗ-21) – З этаж